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机制洞察:分子胶技术的飞跃
CELMoDs库化合物利用了CRBN蛋白的独特结构,特别是其沙利度胺结合域(TBD)和Lon蛋白酶样域(Lon)。通过稳定CRBN的闭合构象,这些化合物增强了这些域之间的接近性和相互作用,从而优化了特定蛋白质的结合和降解。科学文献中的显著例子包括CC-92480(美吉多米德)和CC-220(伊贝多米德),它们能有效结合到CRBN的传感器环,取得了显著的治疗效果。
高级设计和独特功能
1.专为CRBN调制而设计:与通用小分子库不同,CELMoDs库是专门为CRBN稳定而设计的。这种精确性使得选择性降解途径成为可能,这是其他库无法实现的。
2.双重功能:CELMoDs库中的化合物具有双重作用:
(1)作为直接的分子胶,稳定CRBN的功能构象。
(2)作为设计新型PROTAC的潜在弹头。
3.高配体效率(LE):通过先进的分子对接对化合物进行预筛选,以确保在沙利度胺结合位点的最佳结合效率,显著加速药物发现的早期阶段。
综合药物化学见解
CELMoDs库为研究人员提供了一个多功能的工具包,用于靶向蛋白质降解的假设生成和测试。化合物与MedChem兼容,为以下方面提供了宝贵的资源:
1.潜在分子胶的直接筛选。
2.开发替代弹头。
3.CRBN靶向药物开发的药物化学见解。
结构和组成
CELMoDs库包含1256种化合物,分为4个不同的类别,以优化发现流程:
1.长核心:61种化合物与最佳对接模式紧密对齐,与TBD和Lon结构域形成牢固的相互作用。
2.长期多样性:576种不同的化合物探索更广泛的化学空间,同时保持与两个领域的相互作用。
3.高LE核心:293种化合物具有高配体效率,主要占据TBD中沙利度胺的位点。
4.高LE多样性:326种与高配体效率对接模式松散相关的多样化化合物。