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主要特点:
在PPI片段领域的研究揭示了与常见片段相比,较高的分子量对于PPI有更大的接触表面积要求。因此,我们使用“四原则”限制来提取初始的PPI片段子集,因为它们通常更大且更亲脂。此外,还使用了基于机器学习的方法(决策树)和一系列经过验证的描述符来精细调整库的内容。我们应用了“热点”概念,即使用参与PPI的“关键”氨基酸残基。许多选定的片段包含与这些热点相对应的基团/部分结构。此外,该库还富集了具有α螺旋结构的分子,可以模拟蛋白质的结构基元。由于氢键在PPI中通常起着关键作用,因此偏好具有至少一个氢键给体(> 70%)和一个氢键受体(100%)的分子。