JAK/STAT通路调节剂库

Name: JAK/STAT通路调节剂库
Brand: TargetMol
SKU: EN3000

JAK/STAT pathway modulators From Enamine

产品编号 EN3000

该库旨在成为搜索潜在 JAK-STAT 通路调节剂的通用工具。基于蛋白质结构的分析和骨架跳跃方法用于创建适宜的计算机筛选模型。此外，还应用了基于配体的方法来丰富库中的拓扑类似物和与已报道的活性物质相似的化合物。无论感兴趣的特定 SH2 域是什么，得到的库都是配体搜索的通用起点，具有较高的初始靶点发现概率。通过针对 SRC SH2 域的体外筛选验证了该库，结果识别的靶点率为 3.5%。 https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/immuno-oncology-library/jak-stat-pathway-modulators

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产品编号 EN3000

JAK/STAT通路调节剂库

规格

1 mg
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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产品描述

对所有可用的 SH2 结构域结合位点结构进行了分析，并根据其空间分子形状进行了聚类。经过比对分析和聚类后，选择了构象差异大的结构进行虚拟筛选。对110个蛋白质中包含的120个SH2结构域进行了多序列比对。从蛋白质数据库（PDB）中提取了200多个蛋白质结构：66个基于核磁共振的结构和 153 个来自 X 射线晶体学实验的结构。由于结合位点构象的变化可能会对其结合特性产生重大影响，因此所有文件都被拆分成单个结构，从而得到了 1633 个结构总数。关键药效相互作用点：pTyr 结合口袋、结合位点中心的羰基 O、疏水子口袋。
化学化合物的尺寸明显小于与该靶点相互作用的天然肽。因此，在创建化合物库时，我们试图填补磷酪氨酸结合位点附近所有潜在的亚口袋。蛋白质的整个可用表面被有条件地分解成 5 个模型，并以此为基础进行对接后分析。