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库设计
为了设计我们的文库,我们仔细收集了有希望的SARS-CoV蛋白靶向的所有可用结构信息。仔细检查蛋白质结构并创建对接模型。通过简短的MD模拟验证了对接模型,然后通过与报告的活性分子形成复合物的能力进行了验证。我们专注于以下5个靶点和NSP,据报道,NSP对病毒传播最重要,对病毒复制至关重要:
SARS-CoV-2 主要蛋白酶 M亲(也称为 3CL亲)
RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)
木瓜蛋白酶样蛋白酶
血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 受体
II型跨膜丝氨酸蛋白酶(TMPRSS2)
SARS-CoV-2 的非结构蛋白 (NSP),文献报道了3D结构。