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该库的开发过程涉及多个精细步骤,以优化和增强化合物的选择:
1.对ChemDiv库中超过160万种化合物应用软分子复杂性过滤器(MCFs)和药物相似性过滤器,确保仅考虑具有良好药代动力学和药效学特性的化合物。
2.利用Corina软件为每个分子生成精确的3D构象,为进一步分析提供现实基础。
3.自动构建每个构象的三个不同的三中心药效团假设,重点关注HBA、HBD和HYD/LIPO/ARO等关键药效团特征。
4.对所有生成的药效团假设进行聚类,形成最多样化的3D模型池,代表广泛的分子相互作用。
5.使用这个多样化的药效团模型池进行化合物的计算机筛选,以识别最符合假设药效团结构的化合物。
6.从每个药效团簇中选择最多样化的虚拟命中,确保所选化合物全面覆盖操作化学空间,并可能与目标蛋白质有效相互作用。