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⾼通量药物筛选指南(二)
基于表型的药物筛选⽅案
若未明确药物靶点,可以选择从表型⼊⼿筛选有效化合物。基于表型的药物筛选是以拟设计药物作⽤的靶细胞作为研究对象,这是更接近⽣理条件的药物筛选模型。应⽤细胞培养技术获取所需细胞,将这些细胞与候选化合物相互作⽤,通过显微镜或酶标仪收集产⽣的信号评估化合物的作⽤效果,从⽽对化合物进⾏筛选。
TargetMol提供100+肿瘤细胞,助⼒科研⼈员在药物研发的各个阶段进⾏⾼通量筛选、活性化合物发现、结构优化及⽣物活性研究。
>表型筛选参考案例
Fangchinoline suppresses conjunctival melanoma by directly binding FUBP2 and inhibiting the homologous recombination pathway IF=8.46
结膜⿊⾊素瘤(CM)是⼀种罕⻅和致命的眼部肿瘤,约占所有眼部恶性肿瘤的2%,和所有⾮⽪肤⿊⾊素瘤的1.6%。迄今为⽌,丝裂原活化蛋⽩激酶(MEK)抑制剂MEK162是唯⼀⼀种FDA批准的靶向药物,⽤于治疗NRAS突变的晚期⽪肤⿊⾊素瘤。尽管⼀些特定的抑制剂在临床试验中显⽰出积极的效果,但在CM患者中还没有BRAF或NRAS突变靶向药物被批准。
研究⽬的:⽼药新⽤⸺针对1347种抗CM药物进⾏表型筛选获得潜在候选药物,筛选对象为⼀名具有典型NRAS突变的汉族患者的CM-as16细胞。
②通过转录组分析和qRT-PCR检测Fangchinoline对CM-AS16细胞HR通路的影响;
③靶标验证(ABPP),Fangchinoline在CM-AS16细胞中靶向FUBP2;
④Fangchinoline抑制HR通路,增加DNA损伤诱导药物的敏感性;
⑤基因沉默验证Fangchinoline对HR通路的作⽤解析作⽤机制。
>基于表型筛选案例
Blockade of NMT1 enzymatic activity inhibits N-myristoylation of VILIP3 protein and suppresses liver cancer progression IF=39.3
01研究⽬的
肝细胞癌(HCC)是最常⻅的肝癌类型,预后较差,是全球癌症相关死亡的第四⼤原因
研究⽬的:寻找具有抗肿瘤疗效和低毒性的潜在HCC治疗药物药物再利⽤;
02 ⾼通量筛选
⾼通量筛选:FDA上市药物库Cell viability assay CCK8
抗过敏药物地氯雷他定可以抑制HCC细胞系、细胞源异种移植(CDX)、患者源类器官(PDO)、患者源异种移植(PDX)模型
03靶点鉴定
靶标鉴定:DARTS+SPR
确定N-⾁⾖油酰基转移酶1(NMT1)为地氯雷他定的靶蛋⽩
04调节机制
NMT1表达上调可增强肿瘤的体外和体内⽣⻓,⽽NMT1敲低可抑制肿瘤的⽣⻓
05结合位点确认
结合位点确认:分⼦对接+SPR
地氯雷他定与NMT1中的Asn-246结合并抑制其酶活性,破坏NMT1介导的VILIP3蛋⽩⾁⾖醇化和随后的NFκB/Bcl-2信号传导
06研究结论
本研究表明地氯雷他定可能是⼀种新的抗癌药物,NMT1介导的⾁⾖⾁酰化有助于HCC的进展,是HCC的潜在⽣物标志物和治疗靶点。
【CCK-8实验】
【DARTS实验】
【SPR实验】
TargetMol拥有先进的自动化液体工作站,高性能的读板机,熟练专业的技术人员,能对分子水平、细胞水平的各种实验进行条件优化,为您建立稳定,操作简便,数据可靠的实验体系。目前提供的化合物活性筛选服务已覆盖大部分重要靶点,包括酶学靶点、G蛋白偶联受体(GPCRs)、离子通道以及核受体等多项靶点筛选服务和抗肿瘤药物体外筛选服务。TargetMol专业的筛选平台能够帮助您判断化合物是否进入下一阶段的开发流程,为您的药物研发节约宝贵的时间和经费。
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