Riociguat (BAY 632521) 是一种鸟苷酸环化酶的刺激剂，可导致血管平滑肌松弛，用于治疗严重的肺动脉高压。

ODQ 是一种选择性可溶性的鸟苷酰环化酶抑制剂，可增强顺铂促人间皮瘤细胞凋亡的作用。

Methylene Blue (Tetramethylthionine chloride) 是鸟苷酸环化酶，是单胺氧化酶 A 和 NO 合酶抑制剂。它有抗伤害感受、抗疟疾、抗抑郁和抗焦虑作用，可研究高铁血红蛋白血症、神经退行性疾病和异环磷酰胺引起的脑病。它是血管加压剂，用作色素内窥镜检查中的染料。

LY83583 是一种可溶性鸟苷酸环化酶竞争性抑制剂，IC50 为 2 µM。

Nelociguat (BAY60-4552) 是一种一氧化氮敏感的可溶性鸟苷酸环化酶刺激剂。

NS-2028 是一种高度选择性的可溶性鸟苷酸环化酶抑制剂。它抑制 3-吗啉代-sydnonimine 在人培养的脐静脉内皮细胞中形成环状 GMP，IC50为30mM。它抑制小鼠小脑匀浆和神经元 NO 合酶中的可溶性鸟苷酸环化酶活性，IC50分别为 17 和 20 mM。它可降低血管内皮生长因子诱导的血管生成和通透性。

Methylene Blue trihydrate (Basic blue 9) 是鸟苷酸环化酶，单胺氧化酶 A 和 NO 合酶抑制剂。它是血管加压药，在医疗中通常用作染料。它具有抗伤害感受，抗疟疾，抗抑郁和抗焦虑作用，可用于高铁血红蛋白血症，神经退行性疾病和异环磷酰胺引起的脑病的研究。

Nitroprusside disodium dihydrate (Sodium Nitroprusside Dihydrate) 是一种血管扩张剂，通过在血液中自发释放 NO 发挥作用。它可在谷胱甘肽耗竭的成骨细胞中诱导自噬，用于急性高血压和心力衰竭的研究。