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骨架多样性精选库

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产品编号 CB3000

骨架多样性精选库包含 7162个独特分子,涵盖了 6941个结构相似性聚类簇和 3563个Bemis-Murcko框架。该库旨在为药物发现、化学信息学研究和分子库构建提供广泛且多样化的化学空间覆盖。通过精心设计和筛选,让整个库包含多种独特骨架结构的同时保持较小的规模,减少初期筛选的时间与成本,从而提高药物开发的效率和成功率。

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究,不能被用于人体,我们也不向个人提供产品和服务。

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产品编号 CB3000

骨架多样性精选库

规格

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产品描述 产品描述

  • 7162个分子:这些分子经过严格筛选,确保高质量和高多样性。
  • 6941个结构相似性聚类簇:基于Tanimoto相似性指数进行聚类,每个簇内的分子具有高度的结构相似性,而不同簇之间的分子则具有显著的差异。
  • 3563个Bemis-Murcko框架:涵盖了广泛的分子骨架类型,从简单的链状结构到复杂的多环系统,确保对化学空间的全面覆盖,为不同靶点提供更多的结构可能性。
  • 符合 Lipinski 五规则和 Veber 标准,具有较高的成药潜力;
  • 剔除PAINS和不稳定的分子结构,减少筛选假阳性率;
  • NMR/LCMS检测,确保产品结构正确,纯度高,减少假阳性。

优势介绍 优势介绍

骨架多样性精选库符合Lipinski规则,具备良好的成药潜力:

  • 分子量范围300-500,剔除分子量过小的简单分子,减少非特异阳性分子出现的概率,剔除分子量过大的复杂分子,分子更易透过细胞膜,并能降低后续结构改造难度。
  • 氢键受体数范围1-9,控制氢键受体的数量有助于提高化合物的膜通透性和溶解性,从而改善口服吸收。
  • 氢键供体数范围0-5,提高化合物的膜通透性,从而改善口服吸收。
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良好的溶解性质:

  • cLogP范围-4.5~6,主要集中分布于0~4之间。较高的LogP值具有更好的脂溶性,更易透过细胞膜,较低的LogP值具有更好的水溶性,使药物分子更易被吸收。本库的cLogP范围选取适中,在亲脂性和水溶性之间体现较好的平衡。
  • LogSw范围-8~1,主要集中分布于-4~0之间。LogSw在-4~0之间的化合物水溶性更好。
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符合Veber规则,具有良好的口服生物利用度特性:

  • 可旋转键数量范围0~10,主要集中在3~6之间,保持适度的分子刚性,提高结合特异性和生物活性,
  • 拓扑极性表面积范围6~150,主要集中在40~120之间,控制化合物的极性特征,减少与水分子的过度相互作用,提高膜通透性。
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优异的结构多样性,两种多样性挑选方式,提升化合物库结构多样性:

  • 相似性聚类分析:基于MACCS分子指纹,通过70%的Tanimoto相似性阈值聚类分析,挑选结构差异性明显的化合物。本库的聚类簇(Cluster)中有6799个簇仅包含一个化合物,不同化合物之间具有较显著的差异性。
  • Bemis Murcko框架分析:将所有分子分解为其核心骨架和侧链部分,突出其关键结构特征,为每个分子生成Bemis Murcko框架。再对同框架的分子进行多样性挑选,其中2473个Bemis Murcko框架仅挑选1个对应分子,512个Bemis Murcko框架仅挑选2个对应分子。
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Packaging And Storage | TargetMol 包装和储存

  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

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