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SARS-CoV-2 papain-like protease targeted library
我们提供SARS-CoV-2巴氏蛋白酶(PLpro)靶向化合物库,包含1051个预测具有对该蛋白酶活性的化合物。该库是通过使用SARS-CoV-2 PLpro 的晶体结构(PDB ID:6W9C)进行基于受体的虚拟筛选而设计的。
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SARS-CoV-2巴氏蛋白酶(PLpro)是NSP3多域蛋白的一部分,对冠状病毒的复制至关重要。PLpro还具有额外的功能,即从宿主细胞蛋白中剥离泛素和ISG15,以帮助冠状病毒逃避宿主先天免疫反应。因此,该酶是一个有吸引力的抗病毒药物靶点。整个过程包括将Drug-like Green Collection准确灵活地对接到蛋白酶的裂解位点上。通过检查酶活性位点的关键结构决定因子,如配体结合、对接分数以及与关键活性位点氨基酸残基之间的分子间氢键,包括位于拇指和掌亚域之间的经典催化三元组Cys111-His272-Asp286,最终选择化合物。设计的SARS-CoV-2巴氏蛋白酶靶向化合物库只包含药物样化合物(PAINS化合物已被过滤掉)。该库旨在用于筛选项目,以寻找对SARS-CoV-2具有活性的新化合物。
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