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PARP-1(Poly (ADP-ribose) Polymerase 1),又称为NAD+ ADP-核糖基转移酶1或聚(ADP-核糖)合酶1,是一种通过聚(ADP-核糖)化修饰核蛋白的酶。PARP-1通过对下游蛋白进行PARylation来调节DNA修复、DNA复制、转录、DNA甲基化和染色质重塑。它还参与分化、增殖、肿瘤转化,并可能参与I型糖尿病的病理生理过程。PARP(聚(ADP-核糖)聚合酶)抑制剂是一种新型药物,通过阻止癌细胞在被其他化疗药物损伤DNA后修复DNA。
PARP-1靶向化合物库经过精心设计,采用了结构药理筛选和分子对接相结合的方法。结构药理筛选基于六个最佳分辨率的晶体结构(Poly (ADP-ribose) polymerase 1与抑制剂的复合物)进行超重叠。通过对这个模型进行结构药理筛选,得到的得分最高的化合物与人类PARP-1的晶体结构(PDB ID: 4PJT)中的对接化合物重叠。最终化合物的选择是通过对接评分的筛选、分子间疏水接触的检查以及与关键活性位点残基的氢键相互作用进行的。
这个PARP-1靶向化合物库经过精心设计,是一个有预测的PARP-1抑制活性的筛选集合。它为与PARP-1抑制相关的药物发现和开发项目提供了一个优质的基础。