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库设计:
使用Schrödinger软件建立了一个基于已知X射线数据的虚拟筛选工作流程,该数据与一种pyrido[3,4-d]pyrimidin-4(3H)-one衍生物的复合物有关。结合的配体从KDM4A晶体结构中提取。从Life Chemicals的HTS化合物库中预先筛选出具有内部MedChem过滤器(包括PAINS和毒性团过滤器以及五项规则限制)的化合物,然后在活性位点进行对接。对接过程涉及约束两个关键特征,即配体与金属(Zn2+)的配位和配体的疏水基团位于Ty177和Phe185的侧链之间。