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KRAS抑制剂开发方法
抑制KRAS的主要策略包括通过以下方式靶向其表面:
-- 阻断Ras与其效应分子之间的相互作用。
-- 将Ras捕获在非活性构象中,阻止效应分子结合和信号传导。
共价抑制剂分子与新发现的switch-II口袋相互作用。2019年,多种化合物进入临床试验,包括:
-- 安进的AMG 510,
-- Mirati Therapeutics的MRTX849,
-- 强生的JNJ-74699157 (ARS-3248)。
近期进展中,开发了能够结合SI/II口袋的小分子,该口袋存在于KRAS的活性和非活性形式中。这些化合物抑制GTP结合的KRAS与SOS1变构位点及其效应分子(如CRAF和PI3Kα)之间的相互作用。值得注意的是,基因泰克和其他研究团队发现了靶向KRAS switch I和II区域之间浅口袋(SI/II口袋)的分子。
虚拟筛选策略
该方法整合了基于复杂计算工具和理论知识的共识评分与决策流程,包括以下阶段:
-- 用于评估药物相似性和化学可行性的标准“药物化学”过滤器。
-- 与已知K/HRas配体进行二维结构相似性分析,采用Tanimoto度量。
-- 等排体变形程序,用于在保持分子核心特性的同时修改分子结构。
-- 识别并利用已知具有生物活性的优势结构或片段。
-- 从蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)靶向库中精选约5,000种化合物。
-- 规模相近的约5,000种化合物集合,特别设计含有针对KRAS G12C突变体的共价弹头。