ERK5（MAPK7）靶向化合物库

筛选过程中使用了Schrödinger软件中的Glide对接程序。对两个对接模型（基于4IC7和4B99）进行了验证。4IC7结构显示出与共结晶配体构象更好的重现性，配体（ANP）的结晶构象与最佳对接位姿之间的RMSD值为0.6Å。随后，选择了ChEMBL中报告的36个ERK5已知抑制剂（IC50<1µM）作为对接程序的优化和验证的参考分子。使用毒性和不受欢迎的基团过滤参数对Life Chemicals Stock Collection进行了过滤，还应用了PAINS过滤器。基于通过过滤的化合物创建了一个包含50,000个结构的多样化集合。
对接程序的描述：
从配体和结合位点中确定了以下特征和约束对于配体结合是重要的：配体中的嘌呤基团被识别为疏水（芳香）特征；一组残基被指定为负责氢键形成：Met140，Asp200，Glu102，Gln146，Asp143，Arg98，Ala65，Lys84，Arg125，Asp138，Ser71；在默认参数下生成了结合口袋的静电图，包括疏水性和活性残基。然后，进行了从高通量筛选（HTS）到标准对接过程（SP）的顺序筛选。对接结果通过Gscore和Emodel评分函数进行评估。筛选结果与已知ERK5抑制活性化合物的生物数据相关性良好。

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。