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抑制细胞周期依赖性激酶是当前抗癌药物发现研究的重要课题。迄今已报道了几种类型的CDK抑制剂,包括flavopiridole, benzimidazopyrimidines, butyrolactone purine derivatives, staurosporine, indirubin, paullones,等。Life Chemicals使用与抑制剂ICEC0943和ATP-gamma-S结合的CDK7激酶晶体结构来设计CDK7专注和靶向筛选集。采用基于对接的虚拟筛选协议(Schrödinger的Glide,SP模式)在Life Chemicals HTS化合物库中搜索潜在的细胞周期依赖性激酶活性位点结合物。未使用任何对接约束,以允许特殊位置(SP)对接算法探索尽可能多的配体位置和方向。此外,还使用了2D指纹相似性搜索。筛选参考化合物集(从ChEMBL数据库获取的数据)时应用了Tanimoto相似性阈值为85%。参考化合物集中的所有化合物均根据已接受的最大活性值(IC50,Ki50 < 10 mM)进行选择。