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我们的库设计基于在2NP8 PDB条目中记录的Aurora-A ATP结合位点的特定构象。嘧啶基配体与蛋白质活性位点结合引发的构象变化的数量为设计更具特异性的配体提供了机会。通过使用Surflex-Dock工具进行对接,确定了与抑制剂结合的关键氨基酸。根据蛋白质与配体的相互作用,使用SYBYL-X Unity筛选工具准备了蛋白质结合位点的查询模型。利用Unity Flex-Search工具对Life Chemicals库存化合物的预过滤化合物组进行对接过程。以下残基被发现对氢键网络至关重要:Ala213、Pro214、Glu211、Arg137、Gly142和Lys143。蛋白质活性位点的疏水区域也包括在对接约束中。