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SH2 Library
ChemDiv 的 SH2库包含12,000个化合物 Src 同源2(SH2)结构域是由100个氨基酸组成的模块化单元,它们能够识别和结合目标蛋白上的酪氨酸磷酸化肽段,从而介导细胞内蛋白质相互作用。 目前,在 PDB 数据库中有超过50个晶体复合物用于各种小分子 SH2结构域抑制剂的研究。基于选定的 X 射线数据(2WKM,3GQL 和4AOI),构建了4中心药效团模型。然后,参考化合物在构建的模型中进行对接,从二维结构开始,没有进行立体构型的指定。得到的结果与所使用的 RSA 数据良好相关(平均 RMSD=0.2)。 使用开发的药效团模型评估了 SH2结构域库中的所有化合物。高分数的分子被包括在库中(占总数的50%以上)。
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