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ROCK Kinase Targeted Library
Rho相关蛋白激酶(ROCK)是一类丝氨酸/苏氨酸激酶,参与多种细胞运动调节过程,包括细胞迁移、细胞收缩性以及微丝数量的调控。
库中化合物总数:1,360。
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ROCK1和ROCK2同工型已被用作Life Chemicals使用Schrödinger软件进行虚拟筛选的靶点,该软件也用于蛋白质分子构象的制备。两种ROCK激酶结构(PDB ID:2ESM和4L6Q)均通过蛋白质准备工具进行了优化。同时,使用LigPrep模块处理了来自ChEMBL的多个IC50低于1.5 µM的已知ROCK1和ROCK2抑制剂,以生成不同pH状态(Epik)的3D构象。随后,所有对接程序均使用Glide进行(图1)。在对接阶段定义并应用了多个氢键约束和疏水区域。根据对接得分值,从Life Chemicals库存集合中筛选出的对接化合物根据从ChEMBL测试化合物对接获得的得分值范围进行了进一步筛选。