抗病毒化合物库LF

通过2D相似性筛选的抗病毒化合物库
这一抗病毒筛选化合物库是通过对参考集合中46,518个生物活性化合物（IC50、Ki等小于10 μM，抑制率> 25%）进行2D指纹相似性搜索设计的。这些化合物来自于不同病毒物种及其感兴趣的蛋白质的治疗相关病毒测定（从Binding、ChEBI、PubChem和ChEMBL数据库提取）。
随后，使用Tanimoto 80%相似性截断值在MDL公共键指纹上筛选了Life Chemicals HTS化合物集合中具有已知抗不同病毒物种和病毒靶点活性的分子的类似物。总共挑选出了超过15,400种独特的结构多样化化合物用于这一筛选集。

结合配基基础和结构基础方法的抗病毒化合物库
为了识别蛋白质-配体结合机制的关键特征，首先从RCSB Protein Data Bank收集了最有趣和广泛分布的抗病毒分子靶标的相关蛋白质晶体结构。然后从ChEMBLdb（v26）提取了抗病毒分子的参考集合。针对每个靶标具有最高报道抗病毒活性（IC50小于1-1.5 uM）的化合物进行了聚类。从每个组中挑选出的顶级化合物被对接到相应靶标的晶体结构中，以获得生物活性构象。对于没有解析结构的靶标，利用生成构象的刚性对齐和统计分析预测了抑制剂的生物活性构象。这些对齐结构进一步用于体外药效团建模。采用Glide对接和UNITY药效团搜索方法选择了最有前景的与抗病毒相关的化合物。
结合配基基础和结构基础方法用于设计这一抗病毒化合物库，提供了方法交叉验证和更高的准确度。结果，在Life Chemicals HTS化合物集合中鉴定出了超过3,500种潜在的抗病毒药物。所有PAINs和活性化合物均通过内部药物化学过滤器在选择过程中被排除。

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。