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通过与Surflex-Dock工具进行对接,确定了参与抑制剂结合的关键氨基酸残基。基于蛋白质-配体相互作用数据,使用SYBYL-X Unity模块(筛选工具)准备了三个不同的结合模型。
整个Life Chemicals 库存化合物库经过了用于检测和移除Pan Assay干扰(PAINS)化合物的过滤器处理。通过这些过滤器通过的化合物集合的对接结果,共得到了3个针对三种JAK激酶的靶向库,其中这些库之间有一些重叠:
JAK1 - 83个化合物
JAK2 - 338个化合物
JAK3 - 262个化合物