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Insecticides-like library
OTAVAchemicals 提供了一个“类杀虫剂”(Insecticides-Like)库(共含有2,137个化合物)。在设计这个特殊的筛选库时,采用了贝叶斯统计学、药效团建模和QSAR 方法,用于预测杀虫剂的筛选库的构建。
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杀虫剂是用于杀灭害虫的化学物质。它们被认为是20世纪农业生产力增长的主要因素。与此同时,几乎所有的杀虫剂都具有显著改变生态系统的潜力。其中,许多对人类有毒性,其中一些会在食物链中积累。因此,当今继续开发新型有效的杀虫剂。已知的杀虫剂被聚类成四个训练集,用于模型构建。使用不同的药效团特征和排除体积构建、优化和验证药效团模型,然后将OTAVAchemicals筛选库与最佳优化的药效团模型进行筛选(每个训练集使用一个到五个模型)。获得的结果通过两个重评分函数进行重新评分(一个基于药效团特征权重,另一个基于分子描述符(QSAR)),并根据计算分数进行过滤和可视化分析。此外,基于指纹(FCFP4、FCFP6、ECFP4、ECFP6)和不同的分子描述符(LogP、分子量、旋转键的数量、氢受体和供体的数量、环的数量以及分子极性表面积),为相同的训练集构建贝叶斯模型。再对OTAVAchemicals筛选库进行筛选,仅选择得分最高的化合物。
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