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库设计:
首先,我们通过药物化学过滤器对化合物进行了过滤,其中包括PAINS和毒性药团过滤器以及五规则限制。然后,我们分析了人类FGFR1激酶的已知X射线结构,并从3RHX PDB条目中选择了一种蛋白质-抑制剂复合物(具有激酶的非活性构象)进行体外筛选。基于确定的关键氨基酸的特征(Ala564、Glu571、Tyr563、Leu484、Phe489、Asp641、Leu630、Ile545、Phe642、Glu531、Val492、Glu562、Met535),创建了蛋白质结合位点的Unity查询模型(UNITY工具,SYBYL-X)。使用Unity Flex-Search工具对来自Life Chemicals库存集合的预选50,000种多样性集合的配体数据库进行筛选。检索到的命中结果根据QFit值进行过滤。随后,使用Surflex-Dock对所选化合物进行对接,以确定命中物的结合模式并减少假阳性结果。