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Dipeptidyl peptidase-4(DPP4),也称为腺苷脱氨酶结合蛋白或26簇分化标志物(CD26),是一种丝氨酸外切肽酶,能识别具有脯氨酸位于N-末端倒数第二位置的氨基酸序列,并通过去除N-末端脯氨酸二肽而失活此寡肽。
DPP4在葡萄糖代谢中发挥重要作用。动物研究表明,二肽基肽酶4在多种器官(如肝脏和肾脏)纤维化的发展中具有病原学作用。因此,DPP4是开发抗糖尿病试剂和治疗肝脏和肾脏纤维化的重要靶点。目前,DPP4抑制剂用于2型糖尿病的治疗。
第一个模型基于七个晶体的超重叠(二肽基肽酶4与抑制剂的复合物)进行构建(PDB ID:2G5T,3VJM,3NOX,3KWF,2QJR,3HAB,2IIP)。第二个模型是使用从ChEMBL数据库中已知的DPP4抑制剂的训练集开发的三维药效团模型。从两个模型应用中得到的得分最高的化合物进一步在人类DPP4的晶体结构(PDB ID:1X70)中进行对接。最终的化合物选择是通过对接得分的筛选、与关键活性位点残基的分子间疏水接触和氢键的检查来进行的。