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ChemDiv 的小分子丝氨酸共价抑制剂库为发现和开发具有增强特异性和效力的新型治疗药物提供了强大的工具集。这些分子确保持续抑制,通过长期维持一致的药物活性,从而改善治疗效果。这种作用机制最大限度地减少了所需的剂量和给药频率,可能减少副作用并提高患者依从性。此外,这些共价相互作用的不可逆性显著抑制了耐药性的发展,使得这些分子在治疗快速突变率降低非共价抑制剂疗效的疾病中尤为有价值。
库设计:
该库的独特开发流程包括以下阶段:
1、SMARTS查询准备:初始步骤涉及准备一组SMARTS查询,旨在识别具有丝氨酸结合特异性的文献衍生弹头。当前库中详细阐述了10种SMARTS模式。
2、REOS过滤:对ChemDiv制作的160万种化合物库存进行REOS过滤,从而消除结构上不利的基序。
3、弹头模式匹配:扫描过滤后的库存,以识别与预定义弹头SMARTS模式匹配的结构。
4、多样性选择(MaxMin算法):在共享共同弹头支架的化合物组中,采用多样性选择方法。选择标准包括:
a. 确保内部集合相似性不超过0.4(Tanimoto系数和2048位ECFP4指纹)。
优先保留最多样化的结构,并考虑订购类似结构,以促进有前景的命中物的SAR建立。