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Caseinolytic protease ClpP targeted library
ClpP 抑制是治疗人类急性髓系白血病的一种治疗策略。我们开发了ClpP 靶向库(共825种化合物)。这是一个特殊的筛选库,包含预测具有抑制ATP 依赖性Clp 蛋白酶蛋白酶亚基活性的药物样品化合物。
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人类线粒体中的酪蛋白溶解酶(ClpP)是线粒体蛋白质质量控制系统的主要成员。这种丝氨酸蛋白酶能够清除线粒体基质中的损伤或错误折叠的蛋白质。它在广泛的急性髓系白血病(AML)病例中高度表达,但在正常造血前体细胞中则没有表达。Caseinolytic protease ClpP靶向库是通过结合两种基于受体的方法(药效团筛选和分子对接)进行精心设计的。四点药效团模型与排除体积(针对活性中心氨基酸残基的氢原子)基于ClpP与N-甲基甲硫氨酸的结晶结构(PDB ID:1TG6)。从药效团筛选中得到的得分最高的化合物进一步在相同的结晶结构中进行分子对接。最终的化合物选择是通过对接得分的筛选、检查与关键活性位点残基(尤其是催化三元组Ser97、His122和Asp171)的分子间氢键和疏水相互作用进行的。这个库为急性髓系白血病药物发现项目提供了一个极好的基础。
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