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ACII虚拟筛选的主要步骤包括:
1.子结构搜索:此步骤假定识别具有特定化学结构或特征(化学型)的化合物,这些化合物已知与CA II相互作用。
2.化合物对接:将ChemDiv库存中的约10,000种化合物对接到CA II的结合位点是虚拟筛选的实际规模。此过程涉及计算预测小分子(如药物)如何与酶结合。
3.基于对接分数的选择:基于ICM对接分数(< -20.0)和Flare分数(< -7)选择约6,000种化合物是标准方法。这些分数有助于预测化合物的结合亲和力。
4.静电互补性计算:此步骤涉及评估小分子的电子特性如何与目标酶互补。提到了相关性> 0.1的截止值,但应上下文验证此特定值的相关性。
5.物理化学性质预测:使用ICM模型预测化合物的物理化学性质是确保药物相似性和分子可行性的关键步骤。
6.最终选择:该过程以最终选择约5,000种专门针对CA II的化合物结束。此数字似乎与初始过滤步骤一致。