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BioDiversity表型库(总计近11,000个化合物)除了尽可能应用结构差异规则外,还有一个不同的基本原则,即优先考虑化合物的最大生物多样性活性。它包括超过4,100个具有实验生物活性的化合物(包括一些已批准和实验性药物),这些化合物从ChEMBL和DrugBank数据库中提取而来。此外,通过应用2D指纹相似性搜索(Tanimoto ≥ 0.85),该库还增加了3,500个上述生物活性化合物的类似物。此外,还添加了3,400个与天然产物相关的化合物(包括约1,500个类似天然产物的片段),以填充库中更多的生物相关分子。该库不包含反应性、有毒和PAINS化合物,以及具有低水溶性(LogSw)和Caco/MDCK细胞渗透性(计算数据)的化合物。该库中包含了化合物在ChEMBL数据库中的生物活性概况的链接。还提供了各种化合物注释(例如与每个化合物相关联的所有靶点的UniProt ID)。