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转运蛋白是能跨越细胞膜的蛋白质,调节小分子物质在细胞内外的流通。它们在中枢神经系统的神经元之间的化学信号传递中发挥着特别重要的作用,通过控制突触中神经递质的浓度。转运蛋白的另一个关键作用是排除不需要的外源性化合物进入细胞,同时允许细胞生命周期所需的关键分子进入。大多数转运蛋白是药物发现的目标。此外,辅助转运蛋白也是重要的靶点。它们在某种程度上促进一种或多种生物膜的转运,但本身不直接参与转运,并被纳入这个类别。这些蛋白质总是与一个或多个已建立的转运系统相结合发挥作用。它们可以提供与能量耦合转运相关的功能,发挥复合物形成的结构作用,提供生物发生学或稳定性功能,或在调节中发挥作用。为Transporter Modulators库使用了三个活性参考分子的训练集:对于电化学转运蛋白(溶质载体的SLC超家族,囊泡神经递质转运蛋白家族),活性截止值为10 nM;对于主动转运蛋白(ATP结合盒,P型ATP酶,F型和V型ATP酶,内质网逆转座子家族,氧化还原驱动的转运蛋白)和其他转运蛋白(跨膜1电子转移载体,群体转运体),活性截止值为100 nM。