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库设计:
该抗菌化合物库专为抗击细菌感染的前沿研究而设计,以其卓越的多样性和精心筛选的化合物而著称。在5,041次筛选中,其多样性评分达到0.82,展示了广泛的化学实体。库中包含313种独特的杂环化合物,提供了丰富的结构多样性分子。这种多样性有助于探索广泛的抗菌特性和机制。创建该数据库时,使用了超过25万条针对革兰氏阴性菌具有活性确认的小分子化合物化学数据条目。
化合物库设计的核心是其聚类方法,基于Tanimoto指标共包含829个聚类。每个聚类的平均相似度为0.6,每个聚类至少包含三种化合物。这种方法确保每个聚类代表一个独特的化学主题,使研究人员能够在相似的结构框架内系统地探索变异。库的554个信号音进一步增强了其实用性,能够识别特定分子相互作用和针对细菌靶标的活性。该库完全基于7000多种独特结构,经过预处理程序和分析,并在高通量筛选平台上测试,以确定生物活性的主要机制。
该库基于二维相似性和拓扑邻近原则构建,代表了一种抗菌药物发现的战略方法。其结构通过允许研究人员在密切相关的化学空间中进行探索,促进了潜在先导化合物的识别。这种设计特别有利于发现具有独特作用机制的新型化合物,以对抗细菌病原体。该库全面且结构良好的组成使其成为推进抗菌药物发现领域的宝贵资源,为开发针对耐药菌株的有效治疗方法提供了新的前景。