再生医学靶向化合物库

Regenerative Medicine Focused Library

很棒

数量多：含2.3万种小分子化合物，是再生医学相关研究的有力工具；再生医学从诞生起就备受瞩目，修复受损的组织和器官，给医学界带来巨大的变革。不过再生医学领域依然处在起步阶段，对细胞分化机制的研究还不够全面和清晰，再生医学走向临床似乎还有很长的路。不过随着小分子成功调节细胞分化和重编程，再生医学领域又有了新的曙光。目前已报道多种小分子化合物具有促进细胞增殖分化的作用，如 XMU-MP-1可以促进肝脏修复再生，处于临床阶段的 FX-322能够恢复神经性听力损失。另外还有多种小分子同时使用能够诱导体细胞重编程的相关报导。与细胞因子与基因工程等相比，小分子调节剂用于再生医学研究和临床应用的难度更低，并且更有可能大规模生产和使用，惠及全人类。 陶术生物再生医学靶向库基于现有化合物和靶点的基础上，通过计算机虚拟筛选和药效结构分析等方法，从 Chemdiv 160万种类药化合物中筛选出约23000种潜在的再生医学调节剂。严格筛选是提高命中率的重要保证，再生医学靶向库同样经过了严格的筛选步骤。蛋白靶点和结构信息源自常用的 Swiss-Prot 和 PDB 数据库；大量分析学习各数据库（ChEMBL 25, PubMed 和现有文献）中明确报道的再生医学相关的活性小分子。具体筛选步骤如下： 1）计算机数据学习管理：a) KNIME/RDKit, kNN classifier, Distance in BitVector Cosine Space, FCFP12 (10,240 bit) fingerprints; b) Hybrid 2D QSAR/Fingerprint Model - Kernel Chemical Classification/Regression (kcc) 2）3D 形状相似性虚拟筛选； 3）基于结构的（配体，片段，共价片段）对接/虚拟筛选； 4）REOS，MedChem 和 PAINS 过滤器：去除反应性，有毒，混杂和其他不良结构基团； 5）多样性挑选 (Tanimoto)。 陶术生物再生医学靶向库可以用于再生医学相关的药物研发工作，为再生医学研究提供有力的研究工具。

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