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PPI Library (Macrocyclic)
自2008年以来,ASINEX一直致力于蛋白质相互作用( Protein-protein interaction,PPI )库的设计与合成。ASINEX新一代的PPI库包含各种大小、框架和形状的分子,从类似片段的实体到设计为二级结构模拟物或表位模拟物的大环衍生物。该文件包含了从我们的Signature &BioDesign库中选择的所有可用的PPI (大环)化合物。PPI库(大环)中共有3118个化合物。
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在结构模拟物类别中,我们设计了小分子和大环骨架来模拟PPI界面肽结构中的骨架几何结构和侧链的投影。设计涵盖了β-转角/环类似物和α-螺旋类似物。由于62%的蛋白质相互作用中存在螺旋,我们专注于设计、包括模拟α-螺旋的取代结构结构,以及模拟螺旋介导的PPI中“热点”侧链位置的设计。表位模拟物的设计采用了基于结构的设计,重点关注热点残基在PPI界面上的位置。
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