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PDZ PPI Library
ChemDiv针对PDZ结构域的小分子化合物库,用于调控蛋白质-蛋白质相互作用,包含3,055个化合物。
PDZ结构域是普遍存在的蛋白质相互作用模块,能够识别靶蛋白C末端的短氨基酸基序,在调节众多生物过程中发挥关键作用。
通常,PDZ结构域由80-100个氨基酸残基组成,具有共同的拓扑结构,包括六个β链(βA至βF)、一个短α螺旋(αA)和一个较长的α螺旋(αB)。典型PDZ结构域的N端和C端彼此靠近,位于肽结合槽的对面,该槽位于αB螺旋和βB链之间。该结构域在αB和βB结构元件之间的槽中拥有一个单一的结合位点,其特点是βB链前有一个高度保守的羧酸盐结合环。PDZ结构域内的环区域对于配体结合至关重要。含有PDZ结构域的蛋白质可以与多种其他蛋白质相互作用。影响PDZ结构域介导的蛋白质-蛋白质相互作用的调控机制包括磷酸化、二硫键形成、自抑制、竞争性结合和变构效应。
蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)对细胞功能至关重要,其失调与多种疾病相关。鉴于其明确的结合位点,PDZ结构域成为治疗干预的有前景靶点。该结构域在142种人类蛋白质中出现了257次。多个PDZ结构域与疾病进展相关,包括癌症、囊性纤维化、精神分裂症、阿尔茨海默病、帕金森病、禽流感、疼痛和中风,通常通过与疾病相关蛋白质的相互作用实现。为克服肽类药物的局限性,已探索使用小分子。PDZ结构域在疾病通路中的参与凸显了开发选择性靶向PDZ介导相互作用的抑制剂的潜力,从而调节PPIs。此类小分子的一个显著例子是吲哚8,通过虚拟库筛选发现。它能够抑制MAGI3的PDZ2结构域,MAGI3是一种对组织调控和分化至关重要的适配蛋白,证明了这种方法在药物发现中的可行性。
我们针对PDZ结构域的小分子库在药物发现中代表了一种强有力的工具,提供了几项显著优势。首先,它们为识别能够调节对多种细胞过程至关重要且与癌症、神经系统疾病和传染病等多种疾病相关的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的抑制剂提供了一个多功能平台。通过选择性靶向PDZ结构域,我们的库能够发现具有高特异性的化合物,从而可能减少脱靶效应和相关毒性。此外,小分子方法克服了基于肽疗法的局限性,如细胞渗透性和稳定性差,为治疗干预提供了更实用的途径。此外,利用我们的库开发药物有助于探索不同蛋白质中PDZ结构域的结构和功能多样性,增强我们对这些结构域在疾病机制中作用的理解。最终,针对PDZ结构域的小分子库有望产生能够选择性干扰疾病相关PPIs的新型治疗药物,为靶向和有效治疗铺平道路。