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Lipid Metabolism Library
脂质代谢紊乱(包括脂质代谢的遗传性错误)是指在脂肪(或类似脂质物质)的分解或合成过程中出现问题的疾病。脂质代谢紊乱与血液中胆固醇低密度脂蛋白(LDL 胆固醇)、超低密度脂蛋白(VLDL)和甘油三酯等脂质浓度增加相关,常导致心血管疾病。 ChemDiv 虚拟筛选方法 Swiss-Prot 蛋白靶点和 PDB X-射线结构搜索 训练集 - ChEMBL 25,PubMed,当前专利文献(CAS,Integrity) 机器学习数据整理: a)KNIME/RDKit,kNN 分类器,位向量余弦空间距离,FCFP12(10,240位)指纹 b)混合2D QSAR/指纹模型 - 核化学分类/回归(kcc) 3D 形状相似性虚拟筛选: 基于结构的(配体,片段,共价片段)对接/虚拟筛选: a)多重受体构象(MRC)4D 对接; b)配体偏向的集合受体对接(LigBEnD); REOS,MedChem 和 PAINS 过滤器 - 去除反应性,有毒,混杂和其他不良结构基团 多样性挑选(Tanimoto):RDKit 实现的 MaxMin 算法
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