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Halogen-Enriched Fragments
我们的富卤素片段库包含708个溴化片段,可以探索与有利的卤素键相互作用相关的结合位点,以识别与经典的基于片段的筛选得到的结合模式互补的独特结合模式。
该库旨在通过X射线晶体学更有效地识别药物靶点活性位点中结合的片段。卤素键最近在分子设计中引起了越来越多的关注,提供了与传统的极性相互作用(如氢键)相对的选择。涉及主链羰基氧的卤素键被发现可以显著改善多种配体与目标蛋白质的结合。在蛋白质-配体结构中最常见的卤素键是卤素-羰基氧或卤素-π相互作用。量子化学计算还表明,通过与甲硫氨酸的靶向卤素-硫接触,可以增强配体的亲和力和选择性。尽管卤素基团在有利地贡献于配体结合方面具有潜力,但在基于片段筛选的标准库中含有重卤素的化合物数量非常有限。OTAVAchemicals设计的富卤素片段库使用了类似于“三原则”的片段选择标准。作为额外的化学信息学选择规则,这些分子必须含有至少一个溴原子。
从库中删除了下列化合物:
含有与 O、 N、 C、 H、 Br、 I、 Cl、 F、 S 或 P 不同的任何原子的化合物;
不含有至少一个脂肪族或芳香族环的化合物;
含有 4 个以上卤原子的化合物;
含有反应性官能团的化合物具有与目标蛋白质共价结合的风险;
含有可能导致不良影响的功能的化合物,如: 致癌性,毒性,ADME 问题,假阳性。