3D 化合物库（用于HTS）

3D Compound Libraries for HTS

很棒

自由配体的三维形状对于它与目标生物分子的分子识别和与结合位点的亲和性是至关重要的特征。为了与蛋白质靶点结合紧密，药物配体首先应该采用正确的构象和空间互补性，以有效地适应结合位点。使用更复杂、更具三维特性的富含 sp3的筛选化合物无疑可以丰富化学空间，这反过来可能在探索更具挑战性的生物靶点方面具有优势。如果需要对分子形状进行显著的改变，将需要大量的激活能，使得这种化合物不适合作为药物。相反，如果分子已经处于“生物活性构象”（适合结合的合适形状），则更有可能与目标结合强度大，并成为良好的药物。非平面的筛选化合物具有多样化和完善的三维形状，在近几年中已成为高通量筛选中具有吸引力的化合物。命中化合物的更高三维度已被证明与它们成功通过各种临床阶段相关联。 库设计 3D 形状多样性化合物库 所谓的“3D 无形状”是由理想拟合平面（PBF）或惯性主轴（PMI）参数阈值定义的，这些参数目前是描述分子形状的理想指标。对该主题的出版物进行详细分析使我们能够建立一套评估分子三维多样性的准则。基于与物理化学参数相关的这些截断值，应用于 Life Chemicals HTS 化合物库，以得到超过22,700个药物样筛选化合物的选择。 基于3D 药效团的多样性库 首先，将 PAINS 过滤器与 Life Chemicals 内部开发的毒性团和不希望的功能性过滤器应用于 Life Chemicals HTS 化合物库。为每个分子生成一个3D 构象，然后构建三个不同的3中心药效团假设，着重于物理化学参数（HBA，HBD 等点）。然后从每个药效团池中选择多样化的虚拟命中化合物，涵盖广泛的化学空间。总共选择了超过8,700个基于特权3D 骨架的结构多样化筛选化合物，符合这些药效团假设。

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